اهداف کلی این مرکز شامل اجرای پژوهش های همه گیرشناسی بیماری های مغز و اعصاب، اجرای پژوهش های بالینی در زمینه بیماری های مغز و اعصاب، اجرای پژوهش های پایه در زمینه بیماری های مغز و اعصاب، ایجاد و گسترش همکاری های علمی در سطح ملی و بین المللی و آموزش و توانمندسازی پژوهشگران جوان در زمینه بیماری های مغز و اعصاب است.